Vergabe einer Masterarbeit: Weiterentwicklung der Plattform cBioPortal zur Unterstützung des Molekularen Tumorboards
Präsentationsfunktion für Fallbesprechungen
Die translationale Forschungsplattform cBioPortal ist eine Open-Source Anwendung, die Forschenden die Arbeit mit molekularbiologischen Daten erleichtern soll. Im Rahmen des Projekts PM4Onco (BMBF Medizininformatik-Initiative) und des Bayerischen Zentrums für Krebsforschung (BZKF) dient cBioPortal als Basis für eine Softwareplattform für das Molekulare Tumorboard (MTB). In einer Pilotstudie soll nun eine Präsentationsfunktion für Fallbesprechungen entworfen und in einem nutzerzentrierten Design- und Entwicklungsprozess umgesetzt werden.
In Kooperation mit dem Vorbereitungsteam des MTB in Erlangen und weiterer Partnerstandorte soll in einem ersten Schritt eine Übersicht über genutzte Präsentationslösungen für Fallbesprechungen im MTB zusammengestellt werden. Basierend auf diesen Ergebnissen und zusätzlichen ermittelten Anforderungen soll ein Prototyp entwickelt werden, der bedarfsgerechte Fallpräsentation in der Plattform cBioPortal ermöglicht. Abschließend wird eine Evaluation mit den klinischen Endnutzern des entwickelten Prototyps angestrebt.
Ziele:
- Erstellung einer Übersicht von aktuell eingesetzten Präsentationslösungen
- Erhebung von Anforderungen an eine Präsentationsfunktion in cBioPortal
- Entwicklung eines Prototyps
- Evaluation der neu entwickelten Lösung mit Endnutzern
Anforderungsprofil:
- Studium der Informatik, Medizintechnik oder vergleichbarer Disziplinen
- Erfahrung in der Programmierung, vorzugsweise JavaScript/TypeScript
- Idealerweise Erfahrung mit Linux, Open Source Entwicklung über GitHub und Docker
- Idealerweise Kenntnisse auf dem Gebiet der Molekularbiologie
- Von den Bewerbern wird erwartet, dass sie hoch motiviert, kreativ, unabhängig und offen für die interdisziplinäre Zusammenarbeit sind
- Gute Englischkenntnisse in Wort und Schrift von Vorteil
Kontakt:
Dr. Philipp Unberath
Lehrstuhl für Medizinische Informatik