Strukturierung öffentlich verfügbarer Wetterdaten für den Einsatz in medizinischen Datennutzungsprojekten
Projekt-, Bachelor- oder Masterarbeit
Hintergrund
Der Lehrstuhl für Medizinische Informatik beteiligt sich im Rahmen des Projekts CALM-QE z.Zt. an der Integration von Gesundheits-, Wetter- und Umweltdaten mit dem Ziel die Volkskrankheit COPD (Chronisch-obstruktive Lungenerkrankung) in ihren Verläufen und Subtypen besser verstehen und behandeln zu können.
Problemstellung
Wetter -und Klimavariablen haben einen erheblichen Einfluss auf die öffentliche Gesundheit – etwa bei Atemwegserkrankungen, Herz-Kreislauf-Erkrankungen oder der Verbreitung infektiöser Krankheiten.
In den letzten Jahren integrieren Datennutzungsprojekte im medizinischen Umfeld zunehmend Umweltparameter wie Wetter- oder Umweltdaten, um Risikofaktoren besser zu verstehen und davon abhängige Krankheitsverläufe zu modellieren.
Öffentlich verfügbare Wetterdaten (z.B. vom Deutschen Wetterdienst, von NOAA oder ECMWF) sind zwar frei zugänglich, aber häufig unstrukturiert, uneinheitlich und schwer in medizinische Forschungsprozesse integrierbar. Diese Uneinheitlichkeit erschwert die Nachnutzung, Standardisierung und Interoperabilität.
Ziele und Aufgaben
Im Rahmen dieser Arbeit sollen Wetter- und Umweltdaten aus verschiedenen Quellen (Deutscher Wetterdienst, bei Patient:innen aufgestellte Wetterstationen) in ein gemeinsames Format überführt und für Auswertungen mit Bezug auf den Standort, Wetter- & Umweltparameter aufbereitet werden. Hierzu sollen verfügbare Standards untersucht, ein Lösungskonzept für interoperable Datenstrukturen entwickelt und die Transformation der Quelldaten in dieses Format beispielhaft implementiert werden.
Die Arbeit kann entsprechend den Vorkenntnissen & Studienphase der Bewerber:innen sowohl als Projekt- als auch als Bachelor- oder Masterarbeit umgesetzt werden, indem der Umfang angepasst und entsprechende Schwerpunkte gesetzt werden.
Vorkenntnisse und Voraussetzungen
- Hohe Eigenmotivation und Strukturiertheit
- Kenntnisse und Erfahrung in
- Programmiersprache Java
- Datenbankabfragen mit SQL
- Gute deutsche Sprachkenntnisse
Kontakt: Datenintegrationszentrum – https://www.mik.uk-erlangen.de/ueber-uns/datenintegrationszentrum/
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Dr. Lena Raber: lena.raber@uk-erlangen.de Prof. Dr. Thomas Ganslandt thomas.ganslandt@fau.de