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PDF-Report Generierung für das molekulare Tumorboard

Kontakt: Philipp Unberath - philipp.unberath@fau.de - 09131/85-26726

Vergabe einer Projektarbeit:

Hintergrund / Problemstellung:

Zur Unterstützung der Behandlung von Krebspatienten soll im Rahmen des Use Case 3 des MIRACUM Projekts cBioPortal als diagnostisches Tool für das Molekulare Tumorboard eingesetzt werden. Dafür benötigt dieses Tool jedoch noch einige Anpassungen.

Eine wichtige zu implementierende Funktionalität ist die Erstellung von PDF-Reports. Dabei werden alle zum Patienten gespeicherte Daten in übersichtlicher Form zusammengefasst. Die Übersicht soll neben klinischen Daten vor allem Genveränderungen und die damit verbundenen Annotationen enthalten.

Ziele dieser Arbeit:

  • Konzept und Implementierung einer generischen Methode zur Generierung von PDF-Reports in cBioPortal

Aufgaben / Fragestellungen:

  • Wie können die gespeicherten Daten generisch ausgelesen werden?
  • Welche Struktur ist für den generierten Report sinnvoll?
  • Wie kann der Report-Generator in cBioPortal integriert werden?

Anforderungen / Voraussetzungen:

  • Interesse am (molekular-)biologischen Hintergrund hilfreich
  • Grundkenntnisse im Bereich Datenbanken
  • Programmiererfahrung (Java, Typescript)
  • Studiengänge: Informatik, Medizintechnik, IuK oder Vergleichbare

Einstimmende Lektüre: